RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 ALDH1A1P00352 501 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 CLN3Q13286 438 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 MYO19Q96H55 970 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFRSF10AO00220 468 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 GDF9O60383 454 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 COX20Q5RI15 118 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZVU0 165 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 USP3Q9Y6I4 520 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFRSF10BO14763 440 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 TEAD4Q15561 434 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 ABTB2Q8N961 1025 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 STIM2Q9P246 746 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 SERTM1A2A2V5 107 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 EML1O00423 815 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 PTGIRP43119 386 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 CBLBQ13191 982 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 PKDCCQ504Y2 493 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 ITPKCQ96DU7 683 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 CITED4Q96RK1 184 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 DGAT1O75907 488 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 VAMP1P23763 118 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 TMC7Q7Z402 723 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 BCL11AQ9H165 835 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM187AA6NFU0 413 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 NOS2P35228 1153 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 CENPCQ03188 943 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXC1Q12948 553 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 NLRP3Q96P20 1036 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 MEN1O00255 615 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 TREHO43280 583 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 FZD6O60353 706 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 RTN1Q16799 776 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 NGLY1Q96IV0 654 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 CABP1Q9NZU7 370 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 TIMP2P16035 220 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 AAMPQ13685 434 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF787Q6DD87 383 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 RELBQ01201 579 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE3BQ13370 1112 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM129BQ96TA1 746 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 J3QL48 77 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 GPC1P35052 558 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 FGD1P98174 961 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 DGKZQ13574 1117 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 DSC3Q14574 896 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP4X1Q8N118 509 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 MEIOBQ8N635 442 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 TMC1Q8TDI8 760 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHA2P01877 340 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 TCF3P15923 654 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB39O15060 712 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-207ENST00000470201 RECKO95980 971 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-207ENST00000470201 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-207ENST00000470201 USP5P45974 858 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-207ENST00000470201 EHHADHQ08426 723 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 220.3 ms