RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 POLA2Q14181 598 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 BEND3Q5T5X7 828 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 AOX1Q06278 1338 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 HOXB7P09629 217 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 MCM2P49736 904 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 ANAPC15P60006 121 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 IL25Q9H293 177 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 GCP02774 474 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 ORAI2Q96SN7 254 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-207ENST00000462494 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.58■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.58■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 ADCY9O60503 1353 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 CUL4AQ13619 759 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 CNTROBQ8N137 903 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 GPT2Q8TD30 523 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 PROSER3Q2NL68 480 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 PXDNQ92626 1479 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 HSPA4P34932 840 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 CLCN1P35523 988 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 ZNF445P59923 1031 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 ESPNB1AK53 854 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 SGSM2O43147 1006 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 BRD1O95696 1058 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-207ENST00000462494 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 ERBB4Q15303 1308 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 KSR2Q6VAB6 950 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 SPG7Q9UQ90 795 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 RAD50Q92878 1312 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 IL17RAQ96F46 866 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 ALDH1L1O75891 902 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 NCAPD2Q15021 1401 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 MTX1Q13505 466 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 RBSNQ9H1K0 784 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 HYPKQ9NX55 129 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 RASEFQ8IZ41 740 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 SYCE3A1L190 88 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 GPATCH3Q96I76 525 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-207ENST00000462494 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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