RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 BARGINQ6ZT62 677 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 GDF9O60383 454 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 E2F4Q16254 413 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 ABTB2Q8N961 1025 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 RREB1Q92766 1687 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 CPDO75976 1380 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 APBA3O96018 575 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 EVA1CP58658 441 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXD8-202ENST00000429017 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 TLL1O43897 1013 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 GCP02774 474 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PDE3BQ13370 1112 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PRR14Q9BWN1 585 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 TREML4Q6UXN2 200 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 NLRP13Q86W25 1043 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 CABP1Q9NZU7 370 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PEAK1Q9H792 1746 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 SLIT3O75094 1523 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 USP6P35125 1406 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 COL18A1P39060 1754 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PIK3C2AO00443 1686 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 CRB1P82279 1406 aa9.48□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC37A3O60309 1634 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 S1PR4O95977 384 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 AAASQ9NRG9 546 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 SBF2Q86WG5 1849 aa9.46□□□□□ -0.89
HOXD8-202ENST00000429017 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 FAM187AA6NFU0 413 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 ST8SIA5O15466 376 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 NBPF14Q5TI25 921 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 RGPD5Q99666 1765 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 TNFRSF10AO00220 468 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 KCNQ2O43526 872 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 DDB1Q16531 1140 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 AKAP12Q02952 1782 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 CASZ1Q86V15 1759 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 PLSCR1O15162 318 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 SLC4A3P48751 1232 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 EVC2Q86UK5 1308 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 NFAT5O94916 1531 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 SPON1Q9HCB6 807 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 ADH1BP00325 375 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJB2P25686 324 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 BCL9O00512 1426 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HOXD8-202ENST00000429017 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 YY1P25490 414 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB7AO95365 584 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 NEUROD1Q13562 356 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
HOXD8-202ENST00000429017 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms