RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.29■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.29■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 GTF3C6Q969F1 213 aa23.29■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.29■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 RILPL2Q969X0 211 aa23.29■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 ERO1AQ96HE7 468 aa23.29■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 ARID5BQ14865 1188 aa23.28■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.28■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.28■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 MSH6P52701 1360 aa23.28■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 MROH2AA6NES4 1674 aa23.28■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 MAP3K11Q16584 847 aa23.28■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.28■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.28■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.27■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 LIG1P18858 919 aa23.27■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.27■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.27■■□□□ 1.32
GFI1-201ENST00000294702 RUFY3Q7L099 469 aa23.26■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.26■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 RAD50Q92878 1312 aa23.26■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 MTMR6Q9Y217 621 aa23.26■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 HSPA4P34932 840 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 PTPN14Q15678 1187 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 TTC14Q96N46 770 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 KIF3BO15066 747 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 AK2P54819 239 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.25■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.24■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 KIF1BO60333 1816 aa23.24■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 DEPDC5O75140 1603 aa23.24■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 FAM83GA6ND36 823 aa23.24■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.24■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 RGS22Q8NE09 1264 aa23.23■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 LARGE1O95461 756 aa23.23■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 TTC6Q86TZ1 520 aa23.23■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 SSH2Q76I76 1423 aa23.23■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 PLA2G4AP47712 749 aa23.23■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.22■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.22■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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GFI1-201ENST00000294702 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.22■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 KIAA0232Q92628 1395 aa23.22■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 DCTN1Q14203 1278 aa23.21■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.21■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.21■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 PTPRCP08575 1304 aa23.21■■□□□ 1.31
GFI1-201ENST00000294702 HMMRO75330 724 aa23.2■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 GJB2P29033 226 aa23.2■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.2■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 RASEFQ8IZ41 740 aa23.2■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CLCN6P51797 869 aa23.19■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.19■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CPA1P15085 419 aa23.19■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 TNMDQ9H2S6 317 aa23.19■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 DACT1Q9NYF0 836 aa23.19■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 SKILP12757 684 aa23.18■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 ABCC1P33527 1531 aa23.18■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.18■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.18■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 ZNF165P49910 485 aa23.18■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.18■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 POLKQ9UBT6 870 aa23.18■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.17■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.16■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 EFCC1Q9HA90 598 aa23.16■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CDC25BP30305 580 aa23.15■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CCZ1BP86790 482 aa23.15■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.15■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.15■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.14■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 ST5P78524 1137 aa23.14■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.14■■□□□ 1.3
GFI1-201ENST00000294702 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.14■■□□□ 1.29
GFI1-201ENST00000294702 TRIM66O15016 1216 aa23.14■■□□□ 1.29
GFI1-201ENST00000294702 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.14■■□□□ 1.29
GFI1-201ENST00000294702 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GFI1-201ENST00000294702 RNF20Q5VTR2 975 aa23.13■■□□□ 1.29
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