RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NFKBIEO00221 500 aa23.08■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 AIDAQ96BJ3 306 aa23.08■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 TM4SF1P30408 202 aa23.07■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 POTEIP0CG38 1075 aa23.06■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 POTEJP0CG39 1038 aa23.06■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 LBX1P52954 281 aa23.06■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 EYA1Q99502 592 aa23.06■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 WBP1LQ9NX94 342 aa23.06■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 PASKQ96RG2 1323 aa23.06■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 SCN4AP35499 1836 aa23.05■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.05■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.05■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 NEUROD1Q13562 356 aa23.05■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 VEGFBP49765 207 aa23.03■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.03■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 RGS19P49795 217 aa23.01■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL6Q8N841 843 aa23.01■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.01■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 CACNA1SQ13698 1873 aa23■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.99■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.98■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.98■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.97■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.97■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.96■■□□□ 1.27
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SPCS1-201ENST00000233025 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 NFIXQ14938 502 aa22.96■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 ERFEQ4G0M1 354 aa22.96■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPCS1-201ENST00000233025 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.94■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 LDHDQ86WU2 507 aa22.94■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.94■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 ZPR1O75312 459 aa22.93■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 SLX4Q8IY92 1834 aa22.92■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.92■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 SLC24A1O60721 1099 aa22.92■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 CABP4P57796 275 aa22.92■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.91■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 RASSF10A6NK89 507 aa22.9■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 H0YIN7 160 aa22.9■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINB2P05120 415 aa22.9■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 COL15A1P39059 1388 aa22.89■■□□□ 1.26
SPCS1-201ENST00000233025 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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SPCS1-201ENST00000233025 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.89■■□□□ 1.25
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SPCS1-201ENST00000233025 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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SPCS1-201ENST00000233025 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 SCN7AQ01118 1682 aa22.87■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 LTBP1Q14766 1721 aa22.86■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 C21orf2O43822 256 aa22.86■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.86■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 POLKQ9UBT6 870 aa22.86■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.85■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.85■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.85■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.84■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SPCS1-201ENST00000233025 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.83■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 MTHFSP49914 203 aa22.82■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.81■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.8■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.8■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.8■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 MRC1P22897 1456 aa22.79■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.77■■□□□ 1.24
SPCS1-201ENST00000233025 PDE6BP35913 854 aa22.76■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.76■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.76■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.75■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 CNTROBQ8N137 903 aa22.75■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 HACL1Q9UJ83 578 aa22.75■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 EPHX2P34913 555 aa22.74■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.74■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.74■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 BCORQ6W2J9 1755 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-201ENST00000233025 SOGA3Q5TF21 947 aa22.72■■□□□ 1.23
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