RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 VPS11Q9H270 941 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 PELI2Q9HAT8 420 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ZNF358Q9NW07 568 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 WWOXQ9NZC7 414 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ASB1Q9Y576 335 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.97□□□□□ -0.01
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ACTB-206ENST00000443528 STK16O75716 305 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
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ACTB-206ENST00000443528 LY6DQ14210 128 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ACAP2Q15057 778 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.012e-10■■■■■ 70.2
ACTB-206ENST00000443528 FKBP10Q96AY3 582 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.96□□□□□ -0.01
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ACTB-206ENST00000443528 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.96□□□□□ -0.01
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ACTB-206ENST00000443528 CCDC189A1A4V9 331 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MAP2K7O14733 419 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 OR1F1O43749 312 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PRAMEF4O60810 478 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SUPT3HO75486 399 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ALBP02768 609 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CD63P08962 238 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 FAM87AP0C7U9 286 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 GNAZP19086 355 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 EPORP19235 508 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SCTRP47872 440 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 AGTR2P50052 363 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CDC16Q13042 620 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 NKG7Q16617 165 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
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ACTB-206ENST00000443528 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 KCT2Q8NC54 265 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SLC39A7Q92504 469 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MOCOSQ96EN8 888 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MVB12AQ96EY5 273 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CD244Q9BZW8 370 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CTSFQ9UBX1 484 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 FETUBQ9UGM5 382 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SYCE1LA8MT33 242 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 KALRNO60229 2985 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 RFPL1O75677 317 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SHBGP04278 402 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 UMODP07911 640 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 FOLR3P41439 243 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CCR10P46092 362 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 FAM53BQ14153 422 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SSPNQ14714 243 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 NDUFA9Q16795 377 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ATG9BQ674R7 924 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 KLC3Q6P597 504 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 AMER3Q8N944 861 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 THAP4Q8WY91 577 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 COL26A1Q96A83 441 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SPSB2Q99619 263 aa14.94□□□□□ -0.02
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