RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 GADD45GO95257 159 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CCR7P32248 378 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 VEGFBP49765 207 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CCR3P51677 355 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TUBA4AP68366 448 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 RAB39AQ14964 217 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 NUMA1Q14980 2115 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 NEK5Q6P3R8 708 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 GALNT7Q86SF2 657 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 GPR65Q8IYL9 337 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 LGI4Q8N135 537 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ARMC1Q9NVT9 282 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 RHCGQ9UBD6 479 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 GULP1Q9UBP9 304 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 UGT2B17O75795 530 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PRLP01236 227 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 APODP05090 189 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 IDSP22304 550 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 HLA-FP30511 346 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PSMD7P51665 324 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 COQ5Q5HYK3 327 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 Q6ZSR9 355 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ASB1Q9Y576 335 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 A0A096LPI6 279 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 A0A1B0GTL3 188 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TARM1B6A8C7 271 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PDE9AO76083 593 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 SLC16A8O95907 504 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 GGT1P19440 569 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 JAK1P23458 1154 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 STT3AP46977 705 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 HK3P52790 923 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 AFMIDQ63HM1 303 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 NETO1Q8TDF5 533 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 MTERF3Q96E29 417 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 KCNK6Q9Y257 313 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 E7EQ34 232 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PLOD2O00469 737 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 KELP23276 732 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CLDN8P56748 225 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF846Q147U1 533 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 SPIN4Q56A73 249 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 DCST1Q5T197 706 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CPA6Q8N4T0 437 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 FRS2Q8WU20 508 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 SLC9A6Q92581 669 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 MAL2Q969L2 176 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF597Q96LX8 424 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PKMYT1Q99640 499 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 PDPK1O15530 556 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 AIREO43918 545 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CCNB2O95067 398 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 LATS1O95835 1130 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TFAP2AP05549 437 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 LAMP1P11279 417 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 FPR1P21462 350 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TIE1P35590 1138 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TAS2R41P59536 307 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CDK6Q00534 326 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 FPGSQ05932 587 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 SP140Q13342 867 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 LSAMPQ13449 338 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 VMACQ2NL98 169 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ATG9BQ674R7 924 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF773Q6PK81 442 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-206ENST00000368215 MACC1Q6ZN28 852 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 860.1 ms