RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALPQ9UBC7 116 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAU2Q9Y6X3 613 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF33A8MVX0 844 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRP2O60462 931 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALOX12BO75342 701 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBBP7Q16576 425 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL38Q2WGJ6 581 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIRREL2Q6UWL6 708 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPUQ71F23 418 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CILP2Q8IUL8 1156 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4N4Q8N0Y3 316 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTWD1Q8N5C7 304 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS50Q96JG6 964 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPH7Q9BTV6 452 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF304Q9HCX3 659 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA3GQ9NS98 782 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2A25A4D2G3 310 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSTM2BA6NLU5 285 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT14P02533 472 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK-10P10266 1014 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERGP11308 486 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YBX1P67809 324 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBB8Q3ZCM7 444 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD22Q5VYY1 191 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZS92 163 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR7Q8TB68 274 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMPDL3AQ92484 453 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INPP5DQ92835 1189 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICE1Q9Y2F5 2266 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEB16A2A368 324 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO1CO00159 1063 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED26O95402 600 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATP04040 527 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OCA2Q04671 838 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP19Q14CB8 494 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR6A1Q15406 480 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC27Q6P3X3 843 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUSD1Q6UWL2 747 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRB3Q9BUF7 120 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTAGE9A4FU28 777 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP1O94782 785 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLNP12872 115 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD17B2P37059 387 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUM1Q2TAK8 710 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL9Q3SXZ7 439 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4orf17Q53FE4 359 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF470Q6ECI4 717 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO42Q6P3S6 717 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUZD1Q86UP6 607 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR11G2Q8NGC1 345 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STT3BQ8TCJ2 826 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGAP4Q96P64 663 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDR42E2A6NKP2 422 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF2O75151 1096 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS26AO75436 327 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBX6O95503 412 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLRBP48167 497 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCN7P51798 805 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCZ1BP86790 482 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLC1Q07866 573 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRB2Q5IJ48 1285 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIEF2Q96C03 454 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABS1Q96KC9 395 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf90Q96M02 699 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKP4Q99569 1192 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LHPPQ9H008 270 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms