RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCGRP47871 477 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXL2P58012 376 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCRL6Q6DN72 434 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT16Q8N428 558 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB42Q8N4Z0 105 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A11Q9NSA0 550 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GX78 115 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLACEA4D250 179 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL41O60662 606 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP9O95302 570 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALPPP05187 535 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UMODP07911 640 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGAT1P26572 445 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIA3P42263 894 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ1P48048 391 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYBPC3Q14896 1274 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2A13Q16696 494 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIFC1Q9BW19 673 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFS1Q9Y697 457 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VAPBO95292 243 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf105O95561 183 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VARSP26640 1264 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK16Q00536 496 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCTE1Q5JU00 501 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FHL5Q5TD97 284 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRNIPQ6NTE8 343 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZUFSPQ96AP4 578 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP10Q96AY3 582 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOPNLQ96NB1 174 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYBUQ9NX95 663 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP10Q9P2G4 905 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHANK1Q9Y566 2161 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSCR3O14972 297 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGFG2O95081 481 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC175P0C221 793 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGAXP20702 1163 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARNTP27540 789 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNFP41002 786 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BDKRB1P46663 353 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRM7Q14831 915 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCSMST1Q4G0I0 132 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTSL3PQ5NE16 218 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC8BQ6P9F7 803 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CES3Q6UWW8 571 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OVCH1Q7RTY7 1134 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM151BQ8IW70 566 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD3Q96ES6 412 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELENOSQ9BQE4 189 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUTCQ9NTM9 273 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TARM1B6A8C7 271 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PFDN6O15212 129 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP104O60308 925 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ONECUT2O95948 504 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALBP02768 609 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPSB2P20231 275 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM3P25205 808 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMO4P31512 558 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPSAB1Q15661 275 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNSTQ6PJW8 725 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGCLL1Q8TB92 370 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEC3Q8TD91 643 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NACC2Q96BF6 587 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC29A3Q9BZD2 475 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR54Q9H977 334 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8KD6RF30 607 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8TH3BQL2 631 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGPSO00116 658 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IPO13O94829 963 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX8P57073 446 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM58Q8NG06 486 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LPGAT1Q92604 370 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF285Q96NJ3 590 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BIRC8Q96P09 236 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCF12Q99081 682 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIPEPQ99797 713 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENAMQ9NRM1 1142 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX13Q9UN79 622 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD12Q6UB98 2062 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT87PA6NCN2 255 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BMM5 538 aa25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms