RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 OR1L3Q8NH93 324 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 FBF1Q8TES7 1133 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 IFT81Q8WYA0 676 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 CDKL2Q92772 493 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 LINGO1Q96FE5 620 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 TCTN2Q96GX1 697 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 SYTL2Q9HCH5 934 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 WDR70Q9NW82 654 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-206ENST00000443528 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB14O43829 449 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SLC16A8O95907 504 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 WT1P19544 449 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SAT1P21673 171 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 ATP1A2P50993 1020 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 UCNP55089 124 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 TMPRSS3P57727 454 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 TAS2R39P59534 338 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 IL2P60568 153 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 CXADRP78310 365 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 MAP7Q14244 749 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 MANEAQ5SRI9 462 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 FCRL6Q6DN72 434 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 CEP97Q8IW35 865 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 OR8K5Q8NH50 307 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 ZNF480Q8WV37 535 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 VPS39Q96JC1 886 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 CPNE1Q99829 537 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 LHX6Q9UPM6 363 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 PDE10AQ9Y233 779 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 H3BMH7 237 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 K7ENP7 123 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SLC16A5O15375 505 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K7O43318 606 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SYF2O95926 243 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
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ACTB-206ENST00000443528 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 STX2P32856 288 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 HSD17B2P37059 387 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 PNLIPRP1P54315 467 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 VAC14Q08AM6 782 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 ZNF460Q14592 562 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.012e-36■■■■■ 41.6
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ACTB-206ENST00000443528 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 CCDC81Q6ZN84 652 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 RELL1Q8IUW5 271 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 OR2L3Q8NG85 312 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SMPDL3AQ92484 453 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 RBBP8Q99708 897 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 MIPEPQ99797 713 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 FANCEQ9HB96 536 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 NINJ2Q9NZG7 142 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 E7ENX8 843 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 SCRG1O75711 98 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 FAM155BO75949 473 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 FKBP9O95302 570 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 CTSBP07858 339 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 LIFP15018 202 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 IMPA1P29218 277 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 GP5P40197 560 aa15.12■□□□□ 0.01
ACTB-206ENST00000443528 STAT5AP42229 794 aa15.12■□□□□ 0.01
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