RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 CDYLQ9Y232 598 aa17.77■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa17.77■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 HGSO14964 777 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 NVLO15381 856 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 TYROBPO43914 113 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 SLCO2B1O94956 709 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 GSTA1P08263 222 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 CCDC166P0CW27 439 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 THRAP10827 490 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 BRAFP15056 766 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 MPSTP25325 297 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 CRHR1P34998 444 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 GMPRP36959 345 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 DLG1Q12959 904 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 ACSBG2Q5FVE4 666 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 TMEM71Q6P5X7 295 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 NAPRTQ6XQN6 538 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 OR10G6Q8NH81 332 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 SH3KBP1Q96B97 665 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 APOPT1Q96IL0 206 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 DPYSL5Q9BPU6 564 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 COG4Q9H9E3 785 aa17.76■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 PDP2Q9P2J9 529 aa17.76■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 COPEO14579 308 aa17.75■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 RPL10P27635 214 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa17.75■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 CFAP206Q8IYR0 622 aa17.75■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa17.75■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 LINGO1Q96FE5 620 aa17.75■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 GPR78Q96P69 363 aa17.75■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 PRAMEF10O60809 474 aa17.74■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 VCLP18206 1134 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 MAPK10P53779 464 aa17.74■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 UCNP55089 124 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 CXADRP78310 365 aa17.74■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 CSHL1Q14406 222 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 NFE2L1Q14494 772 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 FAM83EQ2M2I3 478 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 SYTL3Q4VX76 610 aa17.74■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 BROXQ5VW32 411 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 METRNLQ641Q3 311 aa17.74■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa17.74■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 CPNE5Q9HCH3 593 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 WASH6PQ9NQA3 447 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 FAM53CQ9NYF3 392 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 FOXJ2Q9P0K8 574 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 ATRXP46100 2492 aa17.74■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 LILRA5A6NI73 299 aa17.73■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.73■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 SPAG7O75391 227 aa17.73■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 CD1DP15813 335 aa17.73■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 PREPP48147 710 aa17.73■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 SLC18A1P54219 525 aa17.73■□□□□ 0.43
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