RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597782.5

TIMM50-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-210ENST00000597782 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.75■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.75■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.74■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.73■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 DCAF5Q96JK2 942 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.71■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 ATG3Q9NT62 314 aa22.71■■□□□ 1.23
TIMM50-210ENST00000597782 MTHFSP49914 203 aa22.7■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 ITPK1Q13572 414 aa22.7■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.7■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 IL13P35225 146 aa22.69■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 CABP4P57796 275 aa22.69■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 SMIM5Q71RC9 77 aa22.68■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.68■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.67■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.67■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.65■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 UTRNP46939 3433 aa22.64■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 KDRP35968 1356 aa22.64■■□□□ 1.22
TIMM50-210ENST00000597782 MMP10P09238 476 aa22.64■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 ADRA2BP18089 450 aa22.64■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.64■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.63■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 ATP10DQ9P241 1426 aa22.63■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 HMOX1P09601 288 aa22.62■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 RFC4P35249 363 aa22.62■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.6■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.59■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 RPS6KA4O75676 772 aa22.58■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.58■■□□□ 1.21
TIMM50-210ENST00000597782 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.57■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 TGFB2P61812 414 aa22.56■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.56■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.55■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.55■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 GYS1P13807 737 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 BCS1LQ9Y276 419 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TIMM50-210ENST00000597782 ADCY9O60503 1353 aa22.51■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.51■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.5■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 A0A0G2JLW4 131 aa22.5■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 CFAP53Q96M91 514 aa22.5■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 FCHSD2O94868 740 aa22.48■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.48■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 MRC1P22897 1456 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 ZPR1O75312 459 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 LGR6Q9HBX8 967 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 C4AP0C0L4 1744 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 DPEP1P16444 411 aa22.46■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 PPP2R1AP30153 589 aa22.46■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TIMM50-210ENST00000597782 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 TJP1Q07157 1748 aa22.44■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 PIM2Q9P1W9 311 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.43■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 FKBP8Q14318 412 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 NUDCQ9Y266 331 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 PRKAR2BP31323 418 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 HSPA6P17066 643 aa22.4■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 SLC39A6Q13433 755 aa22.4■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TIMM50-210ENST00000597782 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TIMM50-210ENST00000597782 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
TIMM50-210ENST00000597782 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.39■■□□□ 1.17
TIMM50-210ENST00000597782 DDR1Q08345 913 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM50-210ENST00000597782 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM50-210ENST00000597782 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms