RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 C21orf2O43822 256 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 SLC19A1P41440 591 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 SCRIBQ14160 1630 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-208ENST00000560725 LGR5O75473 907 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 EPHA4P54764 986 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 SEPT3Q9UH03 358 aa9.76□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 NR3C2P08235 984 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 TNS4Q8IZW8 715 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 HELQQ8TDG4 1101 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.74□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.74□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 E9PSI1 815 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 ADH1AP07327 375 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 FOXK2Q01167 660 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 MTFR1Q15390 333 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 SPRYD7Q5W111 196 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF428Q96B54 188 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 A6NJY4 79 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 NNTQ13423 1086 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 NBPF15Q8N660 670 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.72□□□□□ -0.85
TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ALDH1A1P00352 501 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 SMTNP53814 917 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 TLR1Q15399 786 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 XAGE2Q96GT9 111 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 FAM13AO94988 1023 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 MAPK1P28482 360 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 C16orf46Q6P387 395 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 IL2RAP01589 272 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 NPR3P17342 541 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGAP4P98171 946 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 CLN3Q13286 438 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 CNKSR1Q969H4 720 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 CDK2AP1O14519 115 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 MTMR3Q13615 1198 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ASB16Q96NS5 453 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0G2JS52 829 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1W2PRU2 124 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ECM1Q16610 540 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 POTEAQ6S8J7 498 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 Q6ZVU0 165 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 FOXC1Q12948 553 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 PTGIRP43119 386 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 MMRN1Q13201 1228 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 TBCELQ5QJ74 424 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 ITPKCQ96DU7 683 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 MYO19Q96H55 970 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms