RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.08■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 IL13P35225 146 aa25.07■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 RALBP1Q15311 655 aa25.07■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.07■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.07■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 ITPK1Q13572 414 aa25.05■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 KDRP35968 1356 aa25.05■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 GNPATO15228 680 aa25.03■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.03■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.02■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 ATP6V1AP38606 617 aa25.02■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 C4AP0C0L4 1744 aa25.02■■□□□ 1.6
PUF60-218ENST00000531995 SSFA2P28290 1259 aa25.01■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 ATG3Q9NT62 314 aa25.01■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.01■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.99■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 GRIN3BO60391 1043 aa24.97■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.97■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 TJP1Q07157 1748 aa24.97■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.97■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.96■■□□□ 1.59
PUF60-218ENST00000531995 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.95■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 C1QTNF8P60827 252 aa24.95■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 DCAF5Q96JK2 942 aa24.94■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.94■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 ATP10DQ9P241 1426 aa24.94■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 CFAP53Q96M91 514 aa24.93■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.92■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.91■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 CABP4P57796 275 aa24.9■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.9■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 MMP10P09238 476 aa24.89■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.89■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PUF60-218ENST00000531995 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.89■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 HMOX1P09601 288 aa24.88■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.87■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 ANP32CO43423 234 aa24.87■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 ADCY9O60503 1353 aa24.87■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 CCDC184Q52MB2 194 aa24.86■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 CEP350Q5VT06 3117 aa24.86■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.86■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.85■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 NUDCQ9Y266 331 aa24.83■■□□□ 1.57
PUF60-218ENST00000531995 MRC1P22897 1456 aa24.83■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.82■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.82■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.81■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 ADRA2BP18089 450 aa24.8■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 RFC4P35249 363 aa24.8■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 RPS6KA4O75676 772 aa24.79■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 GYS1P13807 737 aa24.79■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.77■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.77■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.77■■□□□ 1.56
PUF60-218ENST00000531995 FCHSD2O94868 740 aa24.76■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.76■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.75■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 PRKAR2BP31323 418 aa24.75■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.75■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.75■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 A0A0G2JLW4 131 aa24.74■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.74■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 BCS1LQ9Y276 419 aa24.74■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.74■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.73■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 LGR6Q9HBX8 967 aa24.73■■□□□ 1.55
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