RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAK2	O60296	914 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM49B-222	ENST00000522702	CENPC	Q03188	943 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM49B-222	ENST00000522702	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM49B-222	ENST00000522702	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM49B-222	ENST00000522702	CNKSR1	Q969H4	720 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM49B-222	ENST00000522702	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM49B-222	ENST00000522702	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAM23	O75077	832 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	PHKA2	P46019	1235 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GTH6	734 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	APBB1	O00213	710 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	BANK1	Q8NDB2	785 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	KLRG1	Q96E93	195 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	RRAGC	Q9HB90	399 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	XAGE2	Q96GT9	111 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	IL2RA	P01589	272 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGB2	P05107	769 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	EFHC2	Q5JST6	749 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FAM49B-222	ENST00000522702	PROC	P04070	461 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	BMP4	P12644	408 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	USP4	Q13107	963 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	PIK3R2	O00459	728 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	SOCS7	O14512	581 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	AMPD1	P23109	780 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	MSX1	P28360	303 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	THBS1	P07996	1170 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	FGFR3	P22607	806 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	BAG6	P46379	1132 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	7.42	□□□□□ -1.22	6e-11	■■■■■ 31.8
FAM49B-222	ENST00000522702	XP32	Q5T750	250 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	SNRK	Q9NRH2	765 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	CTBS	Q01459	385 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	C2CD2L	O14523	706 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	BNIP3L	O60238	219 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	COL8A1	P27658	744 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	TLR1	Q15399	786 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	BTBD6	Q96KE9	485 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM49B-222	ENST00000522702	GNB5	O14775	395 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR37L1	O60883	481 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	FURIN	P09958	794 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	AIDA	Q96BJ3	306 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	ARAF	P10398	606 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	EPX	P11678	715 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	NLRP8	Q86W28	1048 aa		7.36	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.1 ms