RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 KDRP35968 1356 aa27.38■■□□□ 1.97
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NELFE-212ENST00000492539 PANK3Q9H999 370 aa27.37■■□□□ 1.97
NELFE-212ENST00000492539 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
NELFE-212ENST00000492539 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.36■■□□□ 1.97
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NELFE-212ENST00000492539 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
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NELFE-212ENST00000492539 ATP10DQ9P241 1426 aa27.31■■□□□ 1.96
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NELFE-212ENST00000492539 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.3■■□□□ 1.96
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NELFE-212ENST00000492539 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.24■■□□□ 1.95
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NELFE-212ENST00000492539 ADRA2BP18089 450 aa27.22■■□□□ 1.95
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NELFE-212ENST00000492539 TJP1Q07157 1748 aa27.2■■□□□ 1.94
NELFE-212ENST00000492539 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.2■■□□□ 1.94
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NELFE-212ENST00000492539 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.19■■□□□ 1.94
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NELFE-212ENST00000492539 IL13P35225 146 aa27.18■■□□□ 1.94
NELFE-212ENST00000492539 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.18■■□□□ 1.94
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NELFE-212ENST00000492539 KIF3CO14782 793 aa27.03■■□□□ 1.92
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NELFE-212ENST00000492539 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.94■■□□□ 1.9
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