RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 DKK1O94907 266 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 ITGA6P23229 1130 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 SIX5Q8N196 739 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 ERBB4Q15303 1308 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 CDK2AP1O14519 115 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 BACH1O14867 736 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 SMTNP53814 917 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 A6NJY4 79 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 EPHA4P54764 986 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 CLDN10P78369 228 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 POTEAQ6S8J7 498 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 A0A1B0GTH6 734 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM196BA6NMK8 535 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 FOXK2Q01167 660 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 POU4F2Q12837 409 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 TLR1Q15399 786 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 C4orf17Q53FE4 359 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 GNASQ5JWF2 1037 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF358Q9NW07 568 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 H7C1W4 665 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 VEGFBP49765 207 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 OGFOD1Q8N543 542 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 KIAA1024Q9UPX6 916 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 F11P03951 625 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 RHOQP17081 205 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 GMPRP36959 345 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTK7Q13308 1070 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC102BQ68D86 513 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 SV2AQ7L0J3 742 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 TPCN2Q8NHX9 752 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-790P-201ENST00000384479 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 PSME1Q06323 249 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 TEAD4Q15561 434 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 RASA1P20936 1047 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 SEC13P55735 322 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 DBN1Q16643 649 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARXQ96QS3 562 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L15C9J2P7 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L10C9JJH3 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L12C9JPN9 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L11C9JVI0 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L21D6R901 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L18D6R9N7 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L22D6RA61 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L19D6RCP7 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L20D6RJB6 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 ATP4AP20648 1035 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP17L24Q0WX57 530 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 SERTAD1Q9UHV2 236 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP3Q9Y6I4 520 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 THBS1P07996 1170 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLURP2P0DP57 97 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 MSX1P28360 303 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-790P-201ENST00000384479 KRT76Q01546 638 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms