RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa20.88■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap4B1AUY3 965 aa20.88■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dip2bQ3UH60 1574 aa20.88■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adcy5P84309 1262 aa20.87■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mkrn3Q60764 544 aa20.87■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa20.87■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cavin4A2AMM0 362 aa20.87■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ciz1Q8VEH2 845 aa20.87■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q3UJC8 639 aa20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slit3Q9WVB4 1523 aa20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Capn2O08529 700 aa20.86■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 EzrP26040 586 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PtpruB1AUH1 1446 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Map7d2A2AG50 781 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MyclP10166 368 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adam1bQ8R534 806 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nsd3Q6P2L6 1439 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PzpQ61838 1495 aa20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam184aE9PW83 1143 aa20.83■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vwa3bJ9JI28 736 aa20.83■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa20.83■□□□□ 0.93
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nucb2P81117 420 aa20.83■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm973E9Q295 1059 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp1r15aP17564 657 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 FanclQ9CR14 375 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gcc1Q9D4H2 778 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cps1Q8C196 1500 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AcrbpQ3V140 540 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NexnQ7TPW1 607 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zkscan16A2ALW2 728 aa20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rsph6aQ8CDR2 708 aa20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cabp2Q9JLK4 216 aa20.8■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PaskQ8CEE6 1383 aa20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kcnf1Q7TSH7 493 aa20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4930548H24RikQ9D496 437 aa20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Idi1P58044 227 aa20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Irx2P81066 474 aa20.79■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vamp4O70480 141 aa20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Brpf1B2RRD7 1212 aa20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mcm2P97310 904 aa20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ica1lQ3TY65 431 aa20.78■□□□□ 0.92
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Oas2E9Q9A9 742 aa20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MpripP97434 1024 aa20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 RbsnQ80Y56 783 aa20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc96Q9CR92 584 aa20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fchsd2Q3USJ8 740 aa20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa20.76■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Card6E9PWH2 1175 aa20.75■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cpa2Q504N0 417 aa20.75■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa20.75■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif4a2P10630 407 aa20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp51Q3U4L8 781 aa20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ess2O70279 479 aa20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdkn1cP49919 348 aa20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Taf3Q5HZG4 932 aa20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Oxsr1Q6P9R2 527 aa20.74■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tpd52l1O54818 204 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tshz1Q5DTH5 1084 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ulbp1Q8HWA3 334 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 BbxQ8VBW5 907 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klhdc4Q921I2 584 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf123Q5XPI3 1314 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10563F6WIE4 79 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Casc1Q6TDU8 730 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mmel1Q9JLI3 765 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Erc2Q6PH08 957 aa20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf541Q0GGX2 1363 aa20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NmiO35309 314 aa20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 St18Q80TY4 1045 aa20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa20.72■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mum1Q6DID5 682 aa20.71■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prr29B1ARI9 187 aa20.7■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa20.7■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem94Q7TSH8 1360 aa20.7■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Filip1lQ6P6L0 1131 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp397Q7TNK4 527 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q9D2X8 372 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CenpqQ9CPQ5 267 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp597E9Q6S0 419 aa20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.5 ms