Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rpgrip1Q9EPQ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rpgrip1Q9EPQ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC41.51■■■■■ 4.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rpgrip1Q9EPQ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rpgrip1Q9EPQ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Rpgrip1Q9EPQ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Rpgrip1Q9EPQ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms