Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Rhobtb1Q9DAK3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhobtb1Q9DAK3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rhobtb1Q9DAK3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Rhobtb1Q9DAK3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rhobtb1Q9DAK3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rhobtb1Q9DAK3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhobtb1Q9DAK3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rhobtb1Q9DAK3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rhobtb1Q9DAK3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rhobtb1Q9DAK3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Rhobtb1Q9DAK3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rhobtb1Q9DAK3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rhobtb1Q9DAK3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rhobtb1Q9DAK3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhobtb1Q9DAK3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhobtb1Q9DAK3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rhobtb1Q9DAK3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rhobtb1Q9DAK3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rhobtb1Q9DAK3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rhobtb1Q9DAK3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rhobtb1Q9DAK3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rhobtb1Q9DAK3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Rhobtb1Q9DAK3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhobtb1Q9DAK3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhobtb1Q9DAK3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhobtb1Q9DAK3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rhobtb1Q9DAK3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Rhobtb1Q9DAK3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rhobtb1Q9DAK3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rhobtb1Q9DAK3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rhobtb1Q9DAK3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rhobtb1Q9DAK3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rhobtb1Q9DAK3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rhobtb1Q9DAK3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rhobtb1Q9DAK3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rhobtb1Q9DAK3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rhobtb1Q9DAK3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhobtb1Q9DAK3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhobtb1Q9DAK3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhobtb1Q9DAK3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhobtb1Q9DAK3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rhobtb1Q9DAK3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rhobtb1Q9DAK3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rhobtb1Q9DAK3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rhobtb1Q9DAK3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rhobtb1Q9DAK3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rhobtb1Q9DAK3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rhobtb1Q9DAK3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rhobtb1Q9DAK3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rhobtb1Q9DAK3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhobtb1Q9DAK3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhobtb1Q9DAK3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhobtb1Q9DAK3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhobtb1Q9DAK3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhobtb1Q9DAK3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhobtb1Q9DAK3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rhobtb1Q9DAK3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rhobtb1Q9DAK3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rhobtb1Q9DAK3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rhobtb1Q9DAK3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rhobtb1Q9DAK3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhobtb1Q9DAK3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhobtb1Q9DAK3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rhobtb1Q9DAK3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhobtb1Q9DAK3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rhobtb1Q9DAK3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rhobtb1Q9DAK3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rhobtb1Q9DAK3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rhobtb1Q9DAK3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rhobtb1Q9DAK3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rhobtb1Q9DAK3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rhobtb1Q9DAK3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rhobtb1Q9DAK3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rhobtb1Q9DAK3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rhobtb1Q9DAK3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rhobtb1Q9DAK3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms