Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Rwdd1Q9CQK7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rwdd1Q9CQK7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rwdd1Q9CQK7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rwdd1Q9CQK7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rwdd1Q9CQK7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rwdd1Q9CQK7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rwdd1Q9CQK7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rwdd1Q9CQK7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rwdd1Q9CQK7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rwdd1Q9CQK7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rwdd1Q9CQK7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rwdd1Q9CQK7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rwdd1Q9CQK7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rwdd1Q9CQK7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rwdd1Q9CQK7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rwdd1Q9CQK7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rwdd1Q9CQK7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rwdd1Q9CQK7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rwdd1Q9CQK7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rwdd1Q9CQK7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rwdd1Q9CQK7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rwdd1Q9CQK7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rwdd1Q9CQK7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rwdd1Q9CQK7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rwdd1Q9CQK7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rwdd1Q9CQK7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rwdd1Q9CQK7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rwdd1Q9CQK7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rwdd1Q9CQK7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rwdd1Q9CQK7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rwdd1Q9CQK7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rwdd1Q9CQK7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rwdd1Q9CQK7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rwdd1Q9CQK7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rwdd1Q9CQK7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rwdd1Q9CQK7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rwdd1Q9CQK7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rwdd1Q9CQK7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rwdd1Q9CQK7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rwdd1Q9CQK7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rwdd1Q9CQK7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rwdd1Q9CQK7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rwdd1Q9CQK7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rwdd1Q9CQK7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rwdd1Q9CQK7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rwdd1Q9CQK7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rwdd1Q9CQK7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rwdd1Q9CQK7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rwdd1Q9CQK7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rwdd1Q9CQK7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rwdd1Q9CQK7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rwdd1Q9CQK7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Rwdd1Q9CQK7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rwdd1Q9CQK7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rwdd1Q9CQK7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rwdd1Q9CQK7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rwdd1Q9CQK7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rwdd1Q9CQK7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Rwdd1Q9CQK7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rwdd1Q9CQK7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rwdd1Q9CQK7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rwdd1Q9CQK7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rwdd1Q9CQK7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rwdd1Q9CQK7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rwdd1Q9CQK7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rwdd1Q9CQK7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rwdd1Q9CQK7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rwdd1Q9CQK7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rwdd1Q9CQK7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rwdd1Q9CQK7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms