Protein–RNA interactions for Protein: Q76I26

Methig1, Methyltransferase hypoxia-inducible domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Methig1Q76I26 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Methig1Q76I26 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Methig1Q76I26 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Methig1Q76I26 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Methig1Q76I26 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Methig1Q76I26 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Methig1Q76I26 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Methig1Q76I26 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Methig1Q76I26 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Methig1Q76I26 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Methig1Q76I26 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Methig1Q76I26 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Methig1Q76I26 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Methig1Q76I26 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Methig1Q76I26 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Methig1Q76I26 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Methig1Q76I26 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Methig1Q76I26 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Methig1Q76I26 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Methig1Q76I26 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Methig1Q76I26 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Methig1Q76I26 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Methig1Q76I26 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Methig1Q76I26 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Methig1Q76I26 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Methig1Q76I26 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Methig1Q76I26 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Methig1Q76I26 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Methig1Q76I26 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Methig1Q76I26 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Methig1Q76I26 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Methig1Q76I26 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Methig1Q76I26 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Methig1Q76I26 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Methig1Q76I26 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Methig1Q76I26 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Methig1Q76I26 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Methig1Q76I26 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Methig1Q76I26 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Methig1Q76I26 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Methig1Q76I26 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Methig1Q76I26 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Methig1Q76I26 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Methig1Q76I26 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Methig1Q76I26 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Methig1Q76I26 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Methig1Q76I26 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Methig1Q76I26 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Methig1Q76I26 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Methig1Q76I26 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Methig1Q76I26 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Methig1Q76I26 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Methig1Q76I26 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Methig1Q76I26 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Methig1Q76I26 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Methig1Q76I26 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Methig1Q76I26 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Methig1Q76I26 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Methig1Q76I26 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Methig1Q76I26 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Methig1Q76I26 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Methig1Q76I26 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Methig1Q76I26 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Methig1Q76I26 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Methig1Q76I26 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Methig1Q76I26 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Methig1Q76I26 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Methig1Q76I26 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Methig1Q76I26 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Methig1Q76I26 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Methig1Q76I26 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Methig1Q76I26 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Methig1Q76I26 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Methig1Q76I26 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Methig1Q76I26 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Methig1Q76I26 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Methig1Q76I26 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Methig1Q76I26 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Methig1Q76I26 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Methig1Q76I26 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Methig1Q76I26 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Methig1Q76I26 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Methig1Q76I26 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Methig1Q76I26 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Methig1Q76I26 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Methig1Q76I26 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Methig1Q76I26 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Methig1Q76I26 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Methig1Q76I26 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Methig1Q76I26 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Methig1Q76I26 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Methig1Q76I26 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Methig1Q76I26 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Methig1Q76I26 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Methig1Q76I26 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Methig1Q76I26 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Methig1Q76I26 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Methig1Q76I26 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Methig1Q76I26 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Methig1Q76I26 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms