Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvipQ3UZP4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SvipQ3UZP4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SvipQ3UZP4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SvipQ3UZP4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SvipQ3UZP4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SvipQ3UZP4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvipQ3UZP4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SvipQ3UZP4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvipQ3UZP4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SvipQ3UZP4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SvipQ3UZP4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvipQ3UZP4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SvipQ3UZP4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvipQ3UZP4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SvipQ3UZP4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvipQ3UZP4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SvipQ3UZP4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SvipQ3UZP4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvipQ3UZP4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvipQ3UZP4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SvipQ3UZP4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvipQ3UZP4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SvipQ3UZP4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvipQ3UZP4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SvipQ3UZP4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SvipQ3UZP4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvipQ3UZP4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvipQ3UZP4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SvipQ3UZP4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvipQ3UZP4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SvipQ3UZP4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SvipQ3UZP4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SvipQ3UZP4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SvipQ3UZP4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SvipQ3UZP4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SvipQ3UZP4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SvipQ3UZP4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SvipQ3UZP4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SvipQ3UZP4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SvipQ3UZP4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SvipQ3UZP4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SvipQ3UZP4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SvipQ3UZP4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SvipQ3UZP4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvipQ3UZP4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SvipQ3UZP4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvipQ3UZP4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SvipQ3UZP4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SvipQ3UZP4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SvipQ3UZP4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SvipQ3UZP4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvipQ3UZP4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SvipQ3UZP4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SvipQ3UZP4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvipQ3UZP4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SvipQ3UZP4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvipQ3UZP4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SvipQ3UZP4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvipQ3UZP4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SvipQ3UZP4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SvipQ3UZP4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvipQ3UZP4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvipQ3UZP4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvipQ3UZP4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvipQ3UZP4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvipQ3UZP4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvipQ3UZP4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvipQ3UZP4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvipQ3UZP4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvipQ3UZP4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvipQ3UZP4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SvipQ3UZP4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SvipQ3UZP4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvipQ3UZP4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvipQ3UZP4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.1 ms