Protein–RNA interactions for Protein: Q12412

PNS1, Protein PNS1, yeastyeast

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PNS1Q12412 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.34□□□□□ -2.36
PNS1Q12412 snR6snR6 112 nt0.31□□□□□ -2.36
PNS1Q12412 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.28□□□□□ -2.36
PNS1Q12412 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.27□□□□□ -2.37
PNS1Q12412 snR73snR73 106 nt0.22□□□□□ -2.37
PNS1Q12412 snR161snR161 161 nt0.22□□□□□ -2.37
PNS1Q12412 YJL113WYJL113W 4647 nt0.22□□□□□ -2.38
PNS1Q12412 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.18□□□□□ -2.38
PNS1Q12412 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.15□□□□□ -2.39
PNS1Q12412 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.06□□□□□ -2.4
PNS1Q12412 URB1YKL014C 5295 nt0.06□□□□□ -2.4
PNS1Q12412 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.05□□□□□ -2.4
PNS1Q12412 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.03□□□□□ -2.4
PNS1Q12412 snR58snR58 96 nt0.02□□□□□ -2.41
PNS1Q12412 YOR309CYOR309C 381 nt-0.04□□□□□ -2.42
PNS1Q12412 snR87snR87 109 nt-0.06□□□□□ -2.42
PNS1Q12412 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.09□□□□□ -2.42
PNS1Q12412 snR33snR33 183 nt-0.24□□□□□ -2.45
PNS1Q12412 YNR077CYNR077C 255 nt-0.33□□□□□ -2.46
PNS1Q12412 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.35□□□□□ -2.47
PNS1Q12412 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.35□□□□□ -2.47
PNS1Q12412 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.35□□□□□ -2.47
PNS1Q12412 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.44□□□□□ -2.48
PNS1Q12412 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.7□□□□□ -2.52
PNS1Q12412 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-0.92□□□□□ -2.56
PNS1Q12412 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-0.99□□□□□ -2.57
PNS1Q12412 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.38□□□□□ -2.63
PNS1Q12412 YDR543CYDR543C 300 nt-1.51□□□□□ -2.65
PNS1Q12412 YJR162CYJR162C 351 nt-1.88□□□□□ -2.71
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.4 ms