Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp5eP56382 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp5eP56382 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp5eP56382 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp5eP56382 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp5eP56382 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp5eP56382 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5eP56382 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5eP56382 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5eP56382 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp5eP56382 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp5eP56382 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5eP56382 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp5eP56382 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5eP56382 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp5eP56382 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5eP56382 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp5eP56382 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp5eP56382 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp5eP56382 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp5eP56382 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp5eP56382 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp5eP56382 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp5eP56382 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5eP56382 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp5eP56382 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp5eP56382 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp5eP56382 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp5eP56382 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp5eP56382 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp5eP56382 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5eP56382 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp5eP56382 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp5eP56382 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5eP56382 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp5eP56382 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5eP56382 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp5eP56382 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp5eP56382 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp5eP56382 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp5eP56382 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5eP56382 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5eP56382 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5eP56382 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5eP56382 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp5eP56382 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5eP56382 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5eP56382 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5eP56382 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5eP56382 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5eP56382 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5eP56382 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp5eP56382 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5eP56382 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5eP56382 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5eP56382 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5eP56382 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5eP56382 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5eP56382 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms