Protein–RNA interactions for Protein: E9Q287

Adamts3, A disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts3E9Q287 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Adamts3E9Q287 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Adamts3E9Q287 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Adamts3E9Q287 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Adamts3E9Q287 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Adamts3E9Q287 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Adamts3E9Q287 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Adamts3E9Q287 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Adamts3E9Q287 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Adamts3E9Q287 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Adamts3E9Q287 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Adamts3E9Q287 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Adamts3E9Q287 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Adamts3E9Q287 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Adamts3E9Q287 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Adamts3E9Q287 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Adamts3E9Q287 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Adamts3E9Q287 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Adamts3E9Q287 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Adamts3E9Q287 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Adamts3E9Q287 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Adamts3E9Q287 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Adamts3E9Q287 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts3E9Q287 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Adamts3E9Q287 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Adamts3E9Q287 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Adamts3E9Q287 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Adamts3E9Q287 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Adamts3E9Q287 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Adamts3E9Q287 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Adamts3E9Q287 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Adamts3E9Q287 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Adamts3E9Q287 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Adamts3E9Q287 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Adamts3E9Q287 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Adamts3E9Q287 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Adamts3E9Q287 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Adamts3E9Q287 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Adamts3E9Q287 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Adamts3E9Q287 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Adamts3E9Q287 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Adamts3E9Q287 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Adamts3E9Q287 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Adamts3E9Q287 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Adamts3E9Q287 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Adamts3E9Q287 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Adamts3E9Q287 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Adamts3E9Q287 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Adamts3E9Q287 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Adamts3E9Q287 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Adamts3E9Q287 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Adamts3E9Q287 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Adamts3E9Q287 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Adamts3E9Q287 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Adamts3E9Q287 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Adamts3E9Q287 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Adamts3E9Q287 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Adamts3E9Q287 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Adamts3E9Q287 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Adamts3E9Q287 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Adamts3E9Q287 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Adamts3E9Q287 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Adamts3E9Q287 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Adamts3E9Q287 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Adamts3E9Q287 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Adamts3E9Q287 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Adamts3E9Q287 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Adamts3E9Q287 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Adamts3E9Q287 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Adamts3E9Q287 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Adamts3E9Q287 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Adamts3E9Q287 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Adamts3E9Q287 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Adamts3E9Q287 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Adamts3E9Q287 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Adamts3E9Q287 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Adamts3E9Q287 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Adamts3E9Q287 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Adamts3E9Q287 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Adamts3E9Q287 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Adamts3E9Q287 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Adamts3E9Q287 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Adamts3E9Q287 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Adamts3E9Q287 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Adamts3E9Q287 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Adamts3E9Q287 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Adamts3E9Q287 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Adamts3E9Q287 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Adamts3E9Q287 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Adamts3E9Q287 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Adamts3E9Q287 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Adamts3E9Q287 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Adamts3E9Q287 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Adamts3E9Q287 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Adamts3E9Q287 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Adamts3E9Q287 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Adamts3E9Q287 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Adamts3E9Q287 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Adamts3E9Q287 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Adamts3E9Q287 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.3 ms