Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm5cP41230 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms