Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoP15409 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhoP15409 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RhoP15409 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms