Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-7.12□□□□□ -3.55
SHPRHQ149N8 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-7.15□□□□□ -3.55
SHPRHQ149N8 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-7.19□□□□□ -3.56
SHPRHQ149N8 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-7.21□□□□□ -3.56
SHPRHQ149N8 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-7.32□□□□□ -3.58
SHPRHQ149N8 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-7.5□□□□□ -3.61
SHPRHQ149N8 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-7.5□□□□□ -3.61
SHPRHQ149N8 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-7.58□□□□□ -3.62
SHPRHQ149N8 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-7.63□□□□□ -3.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-7.66□□□□□ -3.64
SHPRHQ149N8 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-7.7□□□□□ -3.64
SHPRHQ149N8 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-7.79□□□□□ -3.66
SHPRHQ149N8 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-7.8□□□□□ -3.66
SHPRHQ149N8 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-7.95□□□□□ -3.68
SHPRHQ149N8 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-7.96□□□□□ -3.68
SHPRHQ149N8 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-7.98□□□□□ -3.69
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-8.14□□□□□ -3.71
SHPRHQ149N8 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-8.38□□□□□ -3.75
SHPRHQ149N8 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-8.41□□□□□ -3.76
SHPRHQ149N8 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-8.42□□□□□ -3.76
SHPRHQ149N8 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-8.46□□□□□ -3.76
SHPRHQ149N8 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-8.5□□□□□ -3.77
SHPRHQ149N8 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-8.91□□□□□ -3.84
SHPRHQ149N8 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-9.04□□□□□ -3.86
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 5.1 ms