Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RRN3Q9NYV6 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3Q9NYV6 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3Q9NYV6 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3Q9NYV6 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RRN3Q9NYV6 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RRN3Q9NYV6 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RRN3Q9NYV6 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
RRN3Q9NYV6 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
RRN3Q9NYV6 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RRN3Q9NYV6 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
RRN3Q9NYV6 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
RRN3Q9NYV6 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
RRN3Q9NYV6 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
RRN3Q9NYV6 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.03□□□□□ -2.89
RRN3Q9NYV6 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
RRN3Q9NYV6 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
RRN3Q9NYV6 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
RRN3Q9NYV6 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
RRN3Q9NYV6 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
RRN3Q9NYV6 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
RRN3Q9NYV6 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
RRN3Q9NYV6 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
RRN3Q9NYV6 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
RRN3Q9NYV6 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
RRN3Q9NYV6 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
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RRN3Q9NYV6 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RRN3Q9NYV6 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RRN3Q9NYV6 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
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RRN3Q9NYV6 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
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RRN3Q9NYV6 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
RRN3Q9NYV6 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
RRN3Q9NYV6 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
RRN3Q9NYV6 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
RRN3Q9NYV6 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
RRN3Q9NYV6 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
RRN3Q9NYV6 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
RRN3Q9NYV6 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
RRN3Q9NYV6 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
RRN3Q9NYV6 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
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