Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CLDN9O95484 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CLDN9O95484 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CLDN9O95484 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CLDN9O95484 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CLDN9O95484 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CLDN9O95484 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CLDN9O95484 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
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CLDN9O95484 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
CLDN9O95484 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CLDN9O95484 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
CLDN9O95484 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
CLDN9O95484 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
CLDN9O95484 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CLDN9O95484 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CLDN9O95484 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
CLDN9O95484 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CLDN9O95484 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CLDN9O95484 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CLDN9O95484 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
CLDN9O95484 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
CLDN9O95484 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
CLDN9O95484 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
CLDN9O95484 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
CLDN9O95484 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CLDN9O95484 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
CLDN9O95484 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CLDN9O95484 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
CLDN9O95484 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
CLDN9O95484 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
CLDN9O95484 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
CLDN9O95484 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
CLDN9O95484 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CLDN9O95484 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
CLDN9O95484 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
CLDN9O95484 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CLDN9O95484 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
CLDN9O95484 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CLDN9O95484 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
CLDN9O95484 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
CLDN9O95484 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
CLDN9O95484 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
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CLDN9O95484 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CLDN9O95484 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
CLDN9O95484 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
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CLDN9O95484 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
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CLDN9O95484 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
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CLDN9O95484 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
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CLDN9O95484 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
CLDN9O95484 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
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CLDN9O95484 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
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CLDN9O95484 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
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CLDN9O95484 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
CLDN9O95484 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CLDN9O95484 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
CLDN9O95484 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
CLDN9O95484 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
CLDN9O95484 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
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CLDN9O95484 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
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CLDN9O95484 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
CLDN9O95484 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
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CLDN9O95484 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
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CLDN9O95484 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CLDN9O95484 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CLDN9O95484 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CLDN9O95484 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CLDN9O95484 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.26□□□□□ -3.09
CLDN9O95484 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
CLDN9O95484 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CLDN9O95484 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CLDN9O95484 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CLDN9O95484 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CLDN9O95484 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CLDN9O95484 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CLDN9O95484 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CLDN9O95484 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
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