Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRAC1Q96KF2 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRAC1Q96KF2 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRAC1Q96KF2 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRAC1Q96KF2 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PRAC1Q96KF2 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PRAC1Q96KF2 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PRAC1Q96KF2 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRAC1Q96KF2 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRAC1Q96KF2 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRAC1Q96KF2 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRAC1Q96KF2 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRAC1Q96KF2 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRAC1Q96KF2 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRAC1Q96KF2 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRAC1Q96KF2 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRAC1Q96KF2 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRAC1Q96KF2 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRAC1Q96KF2 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRAC1Q96KF2 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PRAC1Q96KF2 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PRAC1Q96KF2 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
PRAC1Q96KF2 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PRAC1Q96KF2 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PRAC1Q96KF2 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PRAC1Q96KF2 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PRAC1Q96KF2 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PRAC1Q96KF2 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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