Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLDN19Q8N6F1 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CLDN19Q8N6F1 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CLDN19Q8N6F1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
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