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Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1
CLDN19, Claudin-19, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-44P-201
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BASIC
-2.44
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-974P-201
ENST00000384099
108 nt
BASIC
-2.44
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
Y_RNA.63-201
ENST00000362841
102 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-912P-201
ENST00000363800
104 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
RNY4P30-201
ENST00000410216
95 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
MIR7978-201
ENST00000636158
59 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
MIRLET7A3-201
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BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-242P-201
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107 nt
BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
MIR509-1-201
ENST00000385265
94 nt
BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
MIR509-2-201
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BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-1044P-201
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107 nt
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-2.48
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-530P-201
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107 nt
BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-542P-201
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103 nt
BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
AL731768.1-201
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BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
Y_RNA.788-201
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112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
Y_RNA.830-201
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96 nt
BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
MIR494-201
ENST00000349529
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BASIC
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□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
MIR202-201
ENST00000362219
110 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
Y_RNA.434-201
ENST00000384090
100 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
MIR1254-1-201
ENST00000408257
97 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
MIR3134-201
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74 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
Y_RNA.94-201
ENST00000363068
106 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-800P-201
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103 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-92P-201
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104 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
MIR125B1-201
ENST00000385236
88 nt
BASIC
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□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-523P-201
ENST00000516304
54 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
RNA5SP106-201
ENST00000517274
100 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
Y_RNA.266-201
ENST00000364678
96 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-1276P-201
ENST00000365372
104 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-649P-201
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107 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
AL603908.1-201
ENST00000406098
201 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
MIR548N-201
ENST00000408742
75 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CLDN19
Q8N6F1
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
102 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CLDN19
Q8N6F1
RNY4P10-201
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96 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CLDN19
Q8N6F1
TRAJ9-201
ENST00000390528
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APPRIS P1
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CLDN19
Q8N6F1
MIR450A2-201
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100 nt
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□□□□□ -2.82
CLDN19
Q8N6F1
MIR548AJ2-201
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92 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-687P-201
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89 nt
BASIC
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□□□□□ -2.82
CLDN19
Q8N6F1
MIR548AI-201
ENST00000579940
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CLDN19
Q8N6F1
RNU6-68P-201
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CLDN19
Q8N6F1
SNORD60-201
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Q8N6F1
Y_RNA.652-201
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BASIC
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CLDN19
Q8N6F1
RNU6-520P-201
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Q8N6F1
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BASIC
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Q8N6F1
Y_RNA.139-201
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Q8N6F1
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Q8N6F1
RNU6ATAC17P-201
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Q8N6F1
RNU7-160P-201
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Q8N6F1
AL078612.1-201
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TSL 5
BASIC
-2.59
□□□□□ -2.82
CLDN19
Q8N6F1
SNORD60.1-201
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Q8N6F1
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CLDN19
Q8N6F1
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Q8N6F1
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Q8N6F1
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BASIC
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Q8N6F1
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Q8N6F1
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Q8N6F1
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Q8N6F1
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BASIC
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Q8N6F1
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Q8N6F1
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Q8N6F1
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Q8N6F1
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CLDN19
Q8N6F1
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Q8N6F1
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BASIC
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Q8N6F1
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CLDN19
Q8N6F1
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107 nt
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CLDN19
Q8N6F1
SNORD116.2-201
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BASIC
-2.67
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CLDN19
Q8N6F1
U7.4-201
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63 nt
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-2.67
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CLDN19
Q8N6F1
MIR379-201
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CLDN19
Q8N6F1
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CLDN19
Q8N6F1
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CLDN19
Q8N6F1
SNORD115-45-201
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□□□□□ -2.84
CLDN19
Q8N6F1
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BASIC
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Q8N6F1
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CLDN19
Q8N6F1
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Q8N6F1
RNU6-634P-201
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BASIC
-2.71
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CLDN19
Q8N6F1
RNU6-820P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.84
CLDN19
Q8N6F1
RNU6-345P-201
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107 nt
BASIC
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CLDN19
Q8N6F1
RNU6-1206P-201
ENST00000516339
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.85
CLDN19
Q8N6F1
SNORA25.5-201
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□□□□□ -2.85
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Q8N6F1
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-2.77
□□□□□ -2.85
CLDN19
Q8N6F1
SNORA25.4-201
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CLDN19
Q8N6F1
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BASIC
-2.78
□□□□□ -2.85
CLDN19
Q8N6F1
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BASIC
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□□□□□ -2.85
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Q8N6F1
MIR5582-201
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Q8N6F1
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CLDN19
Q8N6F1
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BASIC
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Q8N6F1
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BASIC
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CLDN19
Q8N6F1
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BASIC
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Q8N6F1
Y_RNA.369-201
ENST00000365568
117 nt
BASIC
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Q8N6F1
SNORD30.1-201
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BASIC
-2.8
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Q8N6F1
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104 nt
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CLDN19
Q8N6F1
RNU7-119P-201
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63 nt
BASIC
-2.83
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CLDN19
Q8N6F1
RNU6-854P-201
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107 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
CLDN19
Q8N6F1
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Q8N6F1
RNU6-1296P-201
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107 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
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