Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SOBPA7XYQ1 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SOBPA7XYQ1 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SOBPA7XYQ1 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SOBPA7XYQ1 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SOBPA7XYQ1 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SOBPA7XYQ1 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.5 ms