Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF239Q16600 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZNF239Q16600 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF239Q16600 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZNF239Q16600 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZNF239Q16600 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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