Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CHD4Q14839 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CHD4Q14839 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD4Q14839 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHD4Q14839 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHD4Q14839 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms