Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SMC1AQ14683 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMC1AQ14683 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMC1AQ14683 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMC1AQ14683 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMC1AQ14683 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMC1AQ14683 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMC1AQ14683 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMC1AQ14683 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMC1AQ14683 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMC1AQ14683 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMC1AQ14683 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMC1AQ14683 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMC1AQ14683 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
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