Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CKAP5Q14008 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CKAP5Q14008 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CKAP5Q14008 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CKAP5Q14008 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CKAP5Q14008 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CKAP5Q14008 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CKAP5Q14008 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CKAP5Q14008 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CKAP5Q14008 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.4 ms