Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIGQ13278 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIGQ13278 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIGQ13278 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RIGQ13278 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIGQ13278 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RIGQ13278 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RIGQ13278 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RIGQ13278 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIGQ13278 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIGQ13278 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RIGQ13278 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIGQ13278 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIGQ13278 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RIGQ13278 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RIGQ13278 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RIGQ13278 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIGQ13278 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIGQ13278 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIGQ13278 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RIGQ13278 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RIGQ13278 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RIGQ13278 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIGQ13278 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIGQ13278 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIGQ13278 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIGQ13278 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RIGQ13278 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIGQ13278 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIGQ13278 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIGQ13278 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIGQ13278 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RIGQ13278 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RIGQ13278 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RIGQ13278 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RIGQ13278 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIGQ13278 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RIGQ13278 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RIGQ13278 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RIGQ13278 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RIGQ13278 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RIGQ13278 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RIGQ13278 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RIGQ13278 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIGQ13278 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIGQ13278 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
RIGQ13278 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RIGQ13278 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIGQ13278 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIGQ13278 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIGQ13278 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RIGQ13278 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIGQ13278 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RIGQ13278 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RIGQ13278 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RIGQ13278 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RIGQ13278 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RIGQ13278 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RIGQ13278 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RIGQ13278 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RIGQ13278 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RIGQ13278 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RIGQ13278 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RIGQ13278 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RIGQ13278 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RIGQ13278 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RIGQ13278 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RIGQ13278 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RIGQ13278 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RIGQ13278 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RIGQ13278 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RIGQ13278 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RIGQ13278 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RIGQ13278 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RIGQ13278 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
RIGQ13278 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RIGQ13278 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RIGQ13278 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIGQ13278 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIGQ13278 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIGQ13278 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIGQ13278 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIGQ13278 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
RIGQ13278 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RIGQ13278 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RIGQ13278 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RIGQ13278 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
RIGQ13278 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
RIGQ13278 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RIGQ13278 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RIGQ13278 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
RIGQ13278 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
RIGQ13278 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms