Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NME3Q13232 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NME3Q13232 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NME3Q13232 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NME3Q13232 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NME3Q13232 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NME3Q13232 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NME3Q13232 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NME3Q13232 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NME3Q13232 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NME3Q13232 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NME3Q13232 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.21□□□□□ -2.76
NME3Q13232 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NME3Q13232 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NME3Q13232 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NME3Q13232 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NME3Q13232 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NME3Q13232 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NME3Q13232 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NME3Q13232 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
NME3Q13232 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
NME3Q13232 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
NME3Q13232 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NME3Q13232 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NME3Q13232 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NME3Q13232 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
NME3Q13232 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NME3Q13232 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NME3Q13232 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NME3Q13232 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NME3Q13232 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NME3Q13232 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NME3Q13232 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NME3Q13232 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.29□□□□□ -2.78
NME3Q13232 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
NME3Q13232 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NME3Q13232 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NME3Q13232 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NME3Q13232 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NME3Q13232 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NME3Q13232 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NME3Q13232 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
NME3Q13232 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NME3Q13232 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NME3Q13232 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NME3Q13232 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NME3Q13232 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NME3Q13232 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NME3Q13232 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NME3Q13232 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NME3Q13232 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NME3Q13232 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NME3Q13232 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NME3Q13232 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NME3Q13232 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
NME3Q13232 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
NME3Q13232 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NME3Q13232 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NME3Q13232 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NME3Q13232 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NME3Q13232 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NME3Q13232 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NME3Q13232 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NME3Q13232 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NME3Q13232 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NME3Q13232 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NME3Q13232 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NME3Q13232 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NME3Q13232 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NME3Q13232 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NME3Q13232 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NME3Q13232 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NME3Q13232 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NME3Q13232 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NME3Q13232 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NME3Q13232 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NME3Q13232 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NME3Q13232 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NME3Q13232 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NME3Q13232 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
NME3Q13232 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
NME3Q13232 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
NME3Q13232 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NME3Q13232 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NME3Q13232 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NME3Q13232 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NME3Q13232 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NME3Q13232 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
NME3Q13232 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
NME3Q13232 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369.4 ms