Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CHAF1BQ13112 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.93□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CHAF1BQ13112 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHAF1BQ13112 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHAF1BQ13112 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHAF1BQ13112 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CHAF1BQ13112 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CHAF1BQ13112 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CHAF1BQ13112 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
CHAF1BQ13112 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHAF1BQ13112 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHAF1BQ13112 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHAF1BQ13112 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHAF1BQ13112 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
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