Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
FOXF1Q12946 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
FOXF1Q12946 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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FOXF1Q12946 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
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FOXF1Q12946 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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FOXF1Q12946 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
FOXF1Q12946 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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FOXF1Q12946 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
FOXF1Q12946 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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FOXF1Q12946 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
FOXF1Q12946 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
FOXF1Q12946 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
FOXF1Q12946 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
FOXF1Q12946 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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