Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ERFP50548 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ERFP50548 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ERFP50548 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ERFP50548 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ERFP50548 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ERFP50548 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.2 ms