Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXD8P13378 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD8P13378 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD8P13378 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD8P13378 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXD8P13378 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HOXD8P13378 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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