Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VPREB1P12018 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VPREB1P12018 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VPREB1P12018 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VPREB1P12018 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VPREB1P12018 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.8 ms