Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms