Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.1 ms