Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
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SYCP1Q15431 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
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SYCP1Q15431 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.2□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
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SYCP1Q15431 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
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