Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LMAN2Q12907 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LMAN2Q12907 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LMAN2Q12907 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LMAN2Q12907 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms