Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NPHP4O75161 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NPHP4O75161 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NPHP4O75161 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NPHP4O75161 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NPHP4O75161 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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NPHP4O75161 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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NPHP4O75161 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
NPHP4O75161 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
NPHP4O75161 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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NPHP4O75161 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
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NPHP4O75161 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
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NPHP4O75161 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NPHP4O75161 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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